CLC DNA Workbench

CLC ДНК Workbench создает программную среду, позволяющую пользователям сделать большое количество передовых последовательности ДНК анализ, в сочетании с гладкой управления данными, и отличные графические возможности просмотра и вывода.
CLC ДНК Workbench доступно на Windows, Mac OS X, а также платформах Linux

Особенности :.

• Биоинформатика имеет в гене Workbench
• Гибкая просмотр кольцевых молекул.
• Редактор для графического и алгоритмически выдвинутой грунтовки дизайна
• Сборка данных последовательностей ДНК
• Молекулярное клонирование
• Автоматическое SNP аннотации последовательностей
• Поиск и обнаружение закономерностей ДНК
• Местные сложность область анализирует
• Обратный перевод с белком в гене, на основе таблиц перевода из числа видов
• Расширенный анализ рестриктазы и управления
• анализы Dot Сюжет, основанный
• Статистика Краткая форма ДНК в том числе ряд характеристик данной молекулы
• NCBI поиск данных последовательность
• Доступ к веб-информации из PubMed
• Другие функции биоинформатика:
• ДНК, РНК и белков редактор последовательность отображения линейных и кольцевых молекул
• ДНК, РНК и белков редактор выравнивания
• Интерактивные логотипы по обе ДНК, РНК и белков выравнивания
• Пакетная обработка анализов на нескольких последовательностей в одном рабочем шага
• Поиск Мотив
• Открытие шаблон (указан модели)

Опция выравнивания
• Расширенный повторно выравнивание и исправить точкой
• Последовательность логотип графики вдоль ДНК, РНК, белков и выравнивания
• Руководство аннотации последовательностей
• поиск Комплексная PubMed
• Веб-поиск, используя последовательность BLAST
• анализы Dot Сюжет, основанный
• Местные сложность область анализирует и сложности участки
• Gap фракция графики
• G / C контент-анализ и графики
• Управление проектами и данные:
• Полная интеграция ввода данных, управление данными, результатами расчета, и экспорт данных
• Детальный журнал истории
• Все типы файлов могут быть сохранены в локальных проектов, и начал с программы
• Импорт и экспорт данных в большом количестве форматов файлов
• Возможность работы в нескольких активных рабочих пространств одновременно, что позволяет одновременно работать с несколькими проектами
• Импорт файлов данных трассировки и качества оценки от автоматизированных машин sequening ДНК с использованием стандартных хроматограмме формат, форматы ABI и формат PHD (Phred)
• Просмотр и отчетность:
• Расширенный вид BLAST
• Расширенный графики смотреть
• Расширенный вид гистограммы
• Расширенный вид точка участок
• Поиск характеристиками в последовательностях и выравнивания

Требования

• 256 Мб оперативной памяти требуется
• 512 Мб оперативной памяти рекомендуется
• 1024 x 768 дисплей рекомендуется

Ограничения

• 4-недельный полностью функциональный демонстрационный