Gabedit

Gabedit является графический интерфейс пользователя к гауссовой, Molcas, Molpro и MPQC вычислительная химия пакетов.
 
 Gabedit включает в себя графическое средства для генерации ключевых слов и вариантов, спецификации молекулы и þér входные секции для самых передовых видов расчета Gabedit включает расширенный Molecule Builder.
 
 Вы можете использовать его, чтобы быстро эскиз в молекулах и изучить их в трех измерениях. Вы можете построить молекулы от атома, кольца, группы, аминокислоты и нуклеозида. Вы также можете прочитать геометрии из файла. Большинство крупных форматов молекулярной файлов поддерживаются.
 
 Gabedit включает в себя окно Setup Расчет Gaussian, Molcas, Molpro и MPQC, которая позволяет настроить гауссовых, Molcas, Molpro и MPQC рабочих мест в простой и понятной форме.
 
 Gabedit включает в себя текстовый редактор для редактирования Molcas, Molpro, Гаусса и MPQC входных файлов.
 
 Gabedit можно графически отобразить различные гауссовой, Molcas, Molpro, MPQC и (частично) результатов расчета АПД, в том числе следующие:
 
 ย ท что молекулярные орбитали.
 ย ท поверхностей от электронной плотности, электростатического потенциала, ЯМР плотности экранирующей и других свойств.
 ย ท Поверхности могут быть отображены в твердых, прозрачных и сетчатых проводном режимах.
 ย ท Поверхности могут быть окрашены в раздельной собственности.
 ย ท Контуры (colorcoded).
 ย ท Самолеты (colorcoded).
 ย ท Диполь
 ย ท оси XYZ и главные оси молекулы.
 ย ท Анимация нормальных режимах, соответствующих колебательных частот.
 ย ท Анимация вращения геометрии, поверхности, диполя, XYZ и главных осей молекулы.
 ย ท Анимация контуров.
 ย ท Анимация colorcoded самолетов.
 
 Gabedit может отображать ИК и КР спектры вычисляются. Gabedit может генерировать POVRAY файл геометрии (атомы + облигаций, в том числе облигации водорода в), поверхностей (в том числе colorcoded поверхностей), контуры, colorcoded самолетов.
 
 Gabedit может спасти картину в PPM, BMP, JPEG) (и формат PS. Gabedit может автоматически генерировать серию фотографий для анимации (вибрации, геометрии сближения, вращения, контуров, colorcoded самолетов)

Что нового В этом выпуске:

• Небольшие ошибки были исправлены.
• NWChem теперь поддерживается.
• Местные Окна игры теперь поддерживается.

Что нового в версии 2.3.5:.

• Небольшие ошибки были исправлены
• Атомы могут быть установлены во время моделирования молекулярной динамики.
• Миграция из Каира в OpenGL для рисования окно геометрии.
• Миграция из gtkglarea в GtkGLExt.
• распараллеливания с помощью OpenMP.

Что нового в версии 2.3.0:.

• Небольшие ошибки были исправлены
• Пользователь может читать орбитали, геометрию и нормальные режимы от fchk гауссовой файла.
• можно прочитать орбитали от нового формата файла MOPAC AUX (в том числе сжатом формате).
• Несколько новых опций в графика XY и ContoursPlot окон (Вставить текст, линии, стрелки, изображения, новые темы ...).
• Длины связей могут быть установлены во время моделирования MD.
• Частичная оптимизация теперь можно с потенциалом MM.
• Реализация инструмента для прогнозирования массы и обилия изотопов для данной молекулы. Реализация инструмента для расчета электрофильные, нуклеофильные и радикальные восприимчивость к молекуле.

Что нового в версии 2.2.0:

• Небольшие ошибки были исправлены
• Все геометрические изменения могут быть отменены и переделано с помощью отмены и повтора (U / U или Ctrl Z / Ctrl у)
• Пользователь имеет полный контроль над отображаемых на чертеже облигаций.
• Розыгрыш атома молекулы атома были упрощены.
• Розыгрыш фрагмента молекулы фрагмента были упрощены.
• Gabedit прочитать связности с Gabedit, хин, PDB, mol2 и моль файлов.
• Пользователь может установить значение расстояния, угла связи и двугранного угла.
• молекулярной динамики конформационного Поиск реализован с использованием потенциала мм (Amber 99).
• молекулярной динамики конформационного Поиск реализован с использованием полуэмпирических методов (из открытых MOPAC или PCGamess).
• Миграция из функций рисования GDK в Каир:. Креста-устройства рендеринга для векторной графики
• Каир в настоящее время используется для графика XY Gabedit виджета (используется Gabedit за ничью спектров).
• Каир в настоящее время используется для графической геометрии.
• Геометрия могут быть экспортированы в EPS, PS, PDF или SVG файл.
• Кривые окна графика XY можно экспортировать в EPS, PS, PDF или SVG файл.
• Новый инструмент для вычислений расстояния между 2 точками на окне графика XY. & Quot; кнопку переключения и Quot Ctrl +; может быть использован для делать зум на окне графика XY.
• Новая версия PCGamess (светлячок) теперь поддерживается

Что нового в версии 2.1.13:

• Небольшие ошибки были фикс
• молекулярной динамики конформационного Поиск реализован с использованием потенциала мм (Amber 99).
• молекулярной динамики конформационного Поиск реализован с использованием полуэмпирических потенциал (используя MOPAC или PCGAMESS).
• можно оптимизировать геометрию в интерактивном режиме с использованием метода MOPAC или PCGamess полуэмпирическую, от геометрии окна Draw
• Миграция из функций рисования GDK в Каир: Кросс-устройства рендеринга для векторной графики. Каир в настоящее время используется для графика XY Gabedit виджета (используется Gabedit за ничью спектров). Каир в настоящее время используется для графической геометрии.
• Геометрия могут быть экспортированы в EPS, PS, PDF или SVG файл. Кривые окна графика XY можно экспортировать в EPS, PS, PDF или SVG файл.
• Новый инструмент для вычислений расстояния между 2 точками на окне графика XY. & Quot; Ctrl + левая кнопка & Quot; может быть использован для делать зум на окне графика XY.
• Новая версия PC GAMESS / Firefly теперь поддерживается

Требования

• GTK +