MACS2 модель инструмент анализа для чип-Seq данных.
С улучшением методов секвенирования, хроматин иммунопреципитации с последующим высокой пропускной секвенирования (чип-Seq) становится популярным для изучения генома взаимодействия белок-ДНК. Для решения проблемы нехватки мощный метод анализа чип-Seq, мы представляем новый алгоритм, названный на основе модели Анализ чип-Seq (MACS), для выявления фактора транскрипции сайты связывания. MACS захватывает влияние сложности генома оценить значимость обогащенных ChIP регионах, и MACS улучшает пространственное разрешение сайты связывания путем объединения информации о положении обоих секвенирования тега и ориентации. . MACS могут быть легко использованы для чип-Seq данных в одиночку, или с контрольным образцом с увеличением специфичности
Требования
- Python
Комментарии не найдены