Швейцарии PdbViewer (ака DeepView) является приложением, которое предоставляет дружественный пользовательский интерфейс, позволяющий проанализировать несколько белков, в то же время. Белки могут быть наложены для того, чтобы вывести структурные выравнивания и сравнить их активные сайты или любые другие соответствующие детали. Мутации аминокислоты, Н-связи, углы и расстояния между атомами легко получить благодаря интуитивной графической и меню интерфейса.
Швейцарии PdbViewer (ака DeepView) были разработаны уже с 1994 года Николя Guex. Швейцарско-PdbViewer тесно связана с SWISS-MODEL, автоматизированной гомологии моделирования сервере, разработанных в рамках Швейцарского института биоинформатики (SIB) в структурной биоинформатики группы на Biozentrum в Базеле.
Работа с этими двумя программами значительно уменьшает объем работы, необходимой для создания моделей, как это можно продеть белка первичную последовательность на 3D шаблона и получить мгновенную обратную связь о том, как хорошо резьбовой белок будет принято эталонным структуры перед отправкой запроса, чтобы построить недостающие петли и усовершенствовать упаковку боковой цепи.
Швейцарии PdbViewer также можете читать карты электронной плотности, а также предоставляет различные инструменты для создания в плотности. Кроме того, различные инструменты моделирования, интегрированных и командные файлы для популярных пакетов минимизации энергии могут быть получены.
Наконец, в качестве специального бонуса, POV-Ray сцены могут быть получены из текущего представления в порядке, чтобы сделать потрясающие Ray-прослеживается качество изображения.
Что нового В этом выпуске:
- Атом тимин С6 теперь корректно загружается
- Исправлен вывод бесконечный цикл POV-Ray на ПК версии
- Случайный сбой при сохранении PDB файлы (например, 2i37) на ПК была установлена
- Обновлены адрес Упсала Электронная плотность Map Server
Комментарии не найдены