инструмент командной строки для сравнения разделенных запятыми файлы данных, используя относительные различия, чтобы определить наиболее похожие конформации. Compsort сравнивает файлы данных, используя относительную разность, вычисляет рейтинг подобия, сортирует результаты в порядке возрастания (более низкие значения представляют большее сходство), сохраняет X количество низких оценок.
Файлы данных, произведенные пользователем, должны быть разделенных запятыми текстовых файлов. Каждый файл представляет собой уникальную молекулу. Каждая строка в файле представляет собой уникальный конформации молекулы. В первой колонке в файле данных должны быть этикетки уникальный конформации, представленной строки. Остальные столбцы числовые дескрипторов, таких как космические измерения расстояний.
Строки сравниваются комбинаторно между файлами. Этикетки по сравнению соединяются и сохраняются с оценками для набора строк. Это дает возможность, чтобы определить конформации, которые произвели данную сходство.
Будущая работа включает в себя:
- , добавив графический интерфейс
- размещения бумаги на моем 3D моделирования алгоритма фармакофор
- Параллельный версия, использующая MPI
Что нового В этом выпуске:
- Исправлена пара незначительные предупреждения компилятора
- добавлено отчетности времени расчета для набора комбинаторных вычислений в дополнение к ранее сообщалось время сортировки
- повышение уровня оптимизации компилятора двоичной
Требования
Mac OS X 10.3
Комментарии не найдены