ZOOM Lite является отображением последовательности и визуализации данных программного обеспечения нового поколения. Входные Люди ссылки геномы и Illumina / Solexa короткий читает файлы или АВ Solid Color пространство читает файлы в различных форматах, таких как * .fasta * .fastq * _seq.txt * .csfasta т.д. ZOOM выводит результаты сопоставления этих краткосрочных считывает на эталонной последовательности. ZOOM Lite имеет быстрое и точное отображение ядро на основе разработанной теории недавно несколько разнесены семян. И один конец и в паре конец читает различной длины от 15bp к 240bp могут быть обработаны. Любое количество несовпадений и одним вставки / удаления различных длин между прочитанным и его целевой области на эталонной последовательности допускается. Уникально отображенные результаты или лучшие (верхний N) результаты для каждого чтения будет сообщено в соответствии с минимальными несоответствия и длиной INDEL. Оценки качества используются для повышения точности отображения. Основываясь на ядре отображения, ZOOM Lite позволяет пользователям загружать локальные данные и считывания данных эталонной последовательности, выберите правильные параметры, данные процесса большое количество параллельно между до четырех процессоров, контролировать запущенные задачи, сохранять результаты отображения, просматривать графики результаты картирования и результаты вывода отображения в любом * .BED или форматы * .GFF файл для дальнейшего обследования с информацией браузеру отслеживать УСК. Результаты картирования можно рассматривать в любом масштабе, из глубины чтения графа над всей хромосомы к подробной выравнивания последовательностей между читает и эталонная последовательность. Люди легко ориентироваться в регионах, представляющих интерес просто с помощью мыши и перетащить или прокрутки. ZOOM Lite является производной от программного обеспечения ZOOM студии
Что нового В этом выпуске:.
Версия 1.5 включает в себя SAM формат экспорта, архитектура настройки, лучшую оптимизацию кода, меньше Программа двоичный размер, и повышен dabase engining для лучшей производительности.
Комментарии не найдены