Шпиндель альтернативный подход к биологической идентификации, основанной на длине рРНК (рРНК) генов регионов. В общем, выравнивание первичных последовательностей рРНК генов из разных видов показывают чередующиеся области сохранения нуклеотидной вариации и, как с точки зрения нуклеотидных замен (обычно называемые "ОНП") и вставки / удаления (INDEL) События. Наличие вставкам результатов в последовательностями различной длины и вводит пробелы в расстановке, как правило, обозначаемые тире "-".
Наша концепция биологической идентификации использует генные последовательности рРНК следующим образом: Консервативные области используются для определения переменных сегментов ("Шпиндель гипервариабельные участки"), в котором комбинация последовательности длин характеристика каждого вида (A "шпиндель профиля"). Таким образом, каждый вид может быть определен уникальным числовым профиль.
В теории, обследование всего 6 гипервариабельных областей с 20 аллелей каждого (или 11 регионов с 5 аллелей каждого) достаточно, чтобы различать все эукариотических видов на Земле, которые, по оценкам, от 5 до 15 млн в количестве. На практике, шпиндель находится в состоянии различать 93,3% эукариотических видов с низким внутривидовой изменчивости и высокой филогенетического резолюции.
Комментарии не найдены