SimSoup

SimSoup это графический симулятор Искусственный Химия Linux и Windows.
Программа позволяет химии должны быть определены в терминах типов молекул и возможных взаимодействий между ними. Моделирование выполнения включает в себя настройку ряда молекул различных типов молекул в реакторе, а затем позволяя Взаимодействия проходить в течение времени. Взаимодействия, происходящие в реакторе, показаны на графическом дисплее.
Мотивация для разработки программы является обеспечение расследования поведения сетей, в частности, по отношению к "метаболизма первого" теорий о происхождении жизни, хотя базовая конструкция SimSoup поддерживает моделирование любой сети, в которой взаимодействие может происходить между узлы.
В настоящее время, развитие SimSoup достиг стадии прототипа.
Вот некоторые ключевые особенности "SimSoup":
ย ท химии: В том числе Типы молекул и типов взаимодействия
ย ท реакторе: В каких взаимодействиях происходить между молекулами разных типов
ย ท Графические Просмотров химии и реактора государства
ย ท Графическое представление моделирования статистики в том числе: -
- Земельные серии Время: Они показывают поведение временных рядов в диапазоне переменных, которые контролируются, как время моделирования
- Manhattan земля: Это показывает изменчивость в составе материала в реакторе в течение времени
ย ท трекеры и цикл обнаружения (NEW): Эти позволяют циклов для обнаружения и мониторинга
ย ท сохранения массы
ย ท Тепло и термодинамика (NEW): скорость реакции на основе соображений энергии и термодинамики
ย ท Сценарий Дисплей: Дисплей текущего сценария и состояние информации о прогрессе
ย ท просит Action (NEW): Эти события, которые могут быть запланированы состоится в определенное время. Например, несоответствия может быть настроен, чтобы вызвать молекулы определенного типа, которые будут добавлены в реактор
ย ท ввода Процессор (NEW): Это позволяет сценарий моделирования должны быть определены в файле и загружается в SimSoup
ย ท Системный монитор: А (частично скрыты) экран - в основном для диагностических целей
ย ท Улучшенный пользовательский интерфейс полностью основана на GTK (NEW)
Требования:
ย ท GSL (GNU научная библиотека)
ย ท GTKMM (C ++ интерфейс для библиотеки GTK + GUI)
Что нового в этой версии:
ย ท трекеры и обнаружение цикла: Они позволяют циклов для обнаружения и мониторинга
ย ท Тепло и термодинамика: скорость реакции на основе соображений энергии и термодинамики
ย ท просит Действие: Это события, которые могут быть запланированы состоится в определенное время. Например, несоответствия может быть настроен, чтобы вызвать молекулы определенного типа, которые будут добавлены в реактор
ย ท ввода Процессор: Это позволяет сценарий моделирования должны быть определены в файле и загружается в SimSoup
ย ท Улучшенный пользовательский интерфейс полностью основана на GTK.