QuasiRecomb

QuasiRecomb это небольшое приложение, которое работает в командной консоли, имитируя модель Маркова для генерации вирусных квазивиды. Он описывает генерацию вирусных квазивидов и способ вывести его параметры путем анализа данных секвенирования следующего поколения. Модель утверждена модельных данных, показывая преимущества явно принимает процесс рекомбинации во внимание, и проходят путем нанесения на чтений с опытных образцов ВИЧ. Он предлагает реализацию алгоритма EM найти максимальные оценки апостериорной параметров модели и метода оценки распределения вирусных штаммов в квазивидов

Требования :.

Java