misopy

MISO (смесь изоформ) является вероятностным рамки написано в Python, что quantitates уровень экспрессии & NBSP; из альтернативного сплайсинга генов из РНК-Seq данных, и определяет дифференцированно регулируемых изоформы или экзонов по образцам.
Путем моделирования генеративной процесс, который считывает изготавливаются из изоформ в РНК-Seq, модель использует MISO байесовский вывод для вычисления вероятности того, что для чтения возникла из конкретной изоформы.
MISO использует INFERRED назначение читает изоформ для количественного содержаний подстилающей множества альтернативных изоформ мРНК. Доверительные интервалы более оценкам могут быть получены, которые количественно надежности оценок.
Пожалуйста, см http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ для MISO руководства и документации

Требования :.

• Python