GenoSuite является основой разработан для proteogenomic анализа. Стратегия, основанная FDRScore используется для интеграции результатов из нескольких поисковых алгоритмов. Прокариотная Proteogenomic Инструмент (PPT) разработана в рамках рамках GenoSuite. PPT для нахождения новых переводы в геномах прокариот и зависит от протеомики данных, основанных масс-спектрометрии и соответствующих геномной последовательности. Особенности включают в себя сконфигурирован для 4 алгоритмов с открытым исходным кодом для выполнения поиска в базе данных для идентификации пептидов и любой комбинации алгоритма 4 можно выбрать, перечисляет поисковые генома конкретные пептиды (новые пептиды), спектральные матчи могут быть визуализированы для оценки качества, перечисляет новые белки и изменения в существующих белков аннотации и визуальный геномной контекст новых пептидов могут также генерироваться.
Комментарии не найдены