BioRuby

BioRuby предоставляет интегрированную среду для биоинформатики (биология информатика).
Объектно-ориентированный язык сценариев Рубин имеет множество функций, пригодных для исследования биоинформатики, например, ясно, синтаксис, чтобы выразить сложные объекты, регулярные выражения для обработки текста, как мощные, как Perl и Rsquo, S широкий спектр библиотек, включая веб-службы и т.д.
Как синтаксис Руби просто и очень чистый, мы считаем, что это легко узнать для новичков, простой в использовании для биологов, а также достаточно мощный для разработчиков программного обеспечения.
В BioRuby, разработчик может получить биологические записи базы данных из плоских файлов, интернет-веб-серверов и локальных реляционных баз данных.
Эти записи базы данных может быть разобран, чтобы извлечь необходимую информацию. Биологические последовательности можно лечить с полноценной методов Рубин & Rsquo; s класс Строка и с регулярными выражениями.
Библиотека может быть интегрирована с инструментами, как Blast, Fasta, HMMER и многих других программных пакетов для биологического анализа.
 BioRuby поддерживает основные форматы биологических данных и предоставляет множество способов для доступа к их через FlatFile индексации, SQL, Web Services и т.д. Различные веб-услуг, включая KEGG API может быть легко использованы BioRuby.

Особенности :