Bibliosphere Analysis Kit

Библиосфера предлагает уникальное сочетание литературы добыче и анализа путей для молекулярных биологов, интересующихся регуляции генов и биологических сетях.
 Библиосфера Путь издание использует всеобъемлющую базу данных индивидуально смоделированных отношений между генами, белками, комплексы, клеток и тканей вместе с до-до-даты текстовых методов добычи для автоматизированного извлечения знаний, чтобы позволить вам связать свои данные в биологических сетях в различных биологических контекстах.
 Используйте Библиосфера к

• расширить биологические сети за канонической информации пути (нормативная и метаболический)
• объединить ваши высокие результаты производительности при работе с биологическим знаниям и последовательности анализа, основанного
• выполнить контекстно- чувствительны нормативно анализ пути
• генерируют эксперимент конкретных вариантов тропинка
• ссылка пути к механизмов болезни & генов
• сделать расширенный опытно-конструкторских

Что нового В этом выпуске:

Новые и усовершенствованные источники данных

• Genomatix Эксперт Куратор Джин-Джин Отношения:
   Genomatix интегрировала собственную базу знаний экспертных куратор данных о регуляции генов в Библиосфера. Это уникальный источник данных, добавляет семантику ген-генных отношений в динамически генерируемых Библиосфера генных сетей, обеспечивая информацию, как "ген А активирует транскрипцию гена B" или "Джин Физически взаимодействует с геном B".
  
• сигнальных путей:
   Части Джин Онтология отношение к передаче сигнала, а также данные, собранные из литературы были объединены для того, чтобы идентифицировать канонических путей, связанных с целенаправленной сети.
  
• метаболический путь ассоциаций:
   Метаболические ассоциации тропинка были интегрированы, чтобы позволить идентификацию метаболических событий, имеющих отношение к вашей набором генов.
  

• Путь Посмотреть с куратором экспертных ген-ген отношения
   Генные группы составляются в легко понятных графиков динамических сетевых сочетающих руки Куратор ген-генных отношения с данными, полученными от автоматического извлечения знаний. Сети могут быть настроены с помощью фильтров и сосредоточены в центре генной способ выполнения кратчайший путь анализа.
  
• Локализация Посмотреть
   На основании GO Аннотации генов относятся к их внутриклеточной локализации и визуализируется в виде показанной компоновки клеток, что позволяет определить регионы и субклеточных отсеков отношение к вашей генной набора.
  

• Управление проектами: Управление анализа, организуя их в папках проекта. Быстрый доступ к ранее результаты с помощью нескольких кликов мыши или добавить новые поиски, чтобы существующие проекты.
  

• Различные мелкие улучшения и исправления

Требования

• Mac OS X 10.2 или выше
• Java 1.4.1 (обновление 1 рекомендуется)
• подключение к интернету
• а оценка счетом Genomatix (бесплатно)