Arabidopsis Motif Сканер (AMS) представляет собой приложение для Windows, который работает на локальных компьютерах. Она была разработана для создания генных сетей путем выявления позиций цис-регуляторных элементов в Резуховидка Таля модель завода и предоставляя простой интерфейс для определения и оценки генных отношений. Ее основная инновационная особенность состоит в объединении позиций элементов цис-регуляторных, NGS и ДНК Chip Массивы экспрессии данных, Arabidopsis аннотациями и взаимодействие генов для идентификации генных сетей, регулируемых факторов транскрипции. В исследованиях, ориентированных на функции транскрипционных факторов, программное обеспечение использует данные экспрессии и связывающие мотивы сайта в регулятивных регионах генов предсказать прямые гены-мишени. Кроме того, AMS использует ДНК-белок и взаимодействие proteinprotein данные для облегчения идентификации метаболических путей, регулируемых фактора транскрипции интересов.
Комментарии не найдены