Супер Биоинформатика для Linux
ProteinShop представляет собой интерактивный инструмент для манипулирования белковых структур. Он был разработан для быстрого создания набора конфигураций белка, используя человеческие знания и интуицию. Эти конфигурации могут быть подвергнуты локальной...
pyNetConv библиотека Python создан, чтобы помочь преобразование некоторых форматов файлов по сети.Начиная с версии 0.6, pyNetConv способен читать / писать (и конвертировать в / из) следующие форматы...
Pysam модуль Python для чтения и манипулирования Samfiles & NBSP;. Это легкий оберткой samtools C-API.Быстрый старт гид здесь. Более подробная документация доступна здесь.Вопросы и комментарии очень приветствуются и должны быть отправлены в группу...
PySCeS проект разработан Triple-J группы по молекулярной клеточной физиологии и NBSP;. для того, чтобы попробовать модель и понять сложные процессы и системы, которые составляют живую клетку Особенности :. Текст основан язык описания модели модуль...
reciprocal_smallest_distance является попарно алгоритм, который использует Ортология глобального выравнивания последовательностей и максимального правдоподобия эволюционный расстояние между последовательностями точно определяет ортологи между геномами....
ПДРФ планировщик является инструментом, который помогает планировать эксперимент ПДРФ: Он находит ферментов рестрикции, которые разрезают набор последовательностей ДНК гомологов по-разному, и в результате имитирует гель-электрофореза изображение....
Печать модуль Python, который обеспечивает выравнивание последовательности на Hadoop.Печать А MapReduce приложение для выравнивания биологического последовательности. Она работает на Hadoop (http://hadoop.apache.org) через Pydoop...
seriesoftubes является расширенной трубопровод для Solexa чип-Seq данных.Пакет документации
Требования
...
системы, как макияж Построить часто используется для создания сложных рабочих процессов, например, биоинформатики & NBSP;. snakemake стремится уменьшить сложность создания рабочих процессов, обеспечивая чистый и современный домена конкретного языка...
SSuMMo библиотека функций, предназначенных вокруг многократно используя HMMER назначить последовательности таксонов & NBSP;. Результаты очень аннотированные деревья, показывающие распределение видов / род в течение этого сообщества.Программы, включенные в...