Лучшие Биоинформатика для Linux
Genepidgin представляет собой набор Python инструментов, которые помогают в названиях оценки и генных назначение NBSP &; Есть три основные компоненты.:genepidgin * очиститель *& NBSP; стандартизирует названия генов за принципов именования...
ШАГИ представляет собой пакет для точного стохастического моделирования систем реакции-диффузии в сколь угодно сложных 3D геометрии. Наш алгоритм ядро моделирования является реализация SSA Гиллеспи, расширен, чтобы иметь дело с диффузии молекул более...
TRMiner это утилита на Python, который направлен на научных кураторов данных & NBSP;. Это позволяет быстро сокращать большие сборники научных публикаций предложениях, имеющих отношение к данной горной цели.Это достигается в два этапа. Во-первых, тексты...
Тест системы Биоинформатика является попыткой построить разумную основу тестирования, тесты и данные, для того, чтобы конечные пользователи и поставщики, чтобы исследовать производительность своих систем.То, что мы пытаемся сделать, это создать основу для...
Штаден Пакет полностью разработан набор сборки последовательности ДНК (Gap4), редактирования и инструментов анализа (спин) для Unix, Linux, MacOSX и MS Windows.На передней Gap4 было несколько мелких присоединения связаннойулучшения в том, как десятки...
АРЕМ является на основе MACS (модели, основанной анализа для чип-Seq данных).Высокая пропускная секвенирование соединен с хроматина иммуно- осадков (чип-Seq) широко используется для характеристики генома обязательных шаблонов транскрипционных факторов,...
seriesoftubes является расширенной трубопровод для Solexa чип-Seq данных.Пакет документации
Требования
...
MetagenomeDB библиотека Python разработана, чтобы легко хранить, извлекать и комментировать метагеномных последовательности и NBSP;. MetagenomeDB выступать в качестве уровня абстракции поверх базы данных MongoDB. Это обеспечивает API для создания и...
Печать модуль Python, который обеспечивает выравнивание последовательности на Hadoop.Печать А MapReduce приложение для выравнивания биологического последовательности. Она работает на Hadoop (http://hadoop.apache.org) через Pydoop...
MISO (смесь изоформ) является вероятностным рамки написано в Python, что quantitates уровень экспрессии & NBSP; из альтернативного сплайсинга генов из РНК-Seq данных, и определяет дифференцированно регулируемых изоформы или экзонов по образцам.Путем...