PANAMA

Панама роман вероятностная модель для объяснения вмешивающихся факторов в исследованиях eQTL, написанных в Python.
Скрытые сопутствующие факторы, такие как ненаблюдаемых регрессоров или неизвестных тонких экологических возмущений может создать ложные ложные ассоциации или замаскировать реальные сигналы генетические ассоциации. В отличие от предыдущих методов, ПАНАМА узнает скрытые факторы совместно с эффектом известных генетических регуляторов. В результате, эта новая модель может более точно отличить истинные сигналы генетической связи с изменением искажающего.
Н. Фуси, о. Stegle и Н. Д. Лоуренс, "Совместное моделирование смешанных факторов и выдающихся генетических регуляторов обеспечивает повышенную точность в генетические исследования геномики», PLoS вычислительная биология 2012
Больше информации на http://ml.sheffield.ac.uk/qtl/panama.html

Requirements:

• Python