Ghemical является вычислительная химия пакет программного обеспечения, распространяемое по лицензии GNU GPL. Это означает, что полный исходный код пакета доступны, и пользователи могут свободно изучать и модифицировать пакет. Ghemical написано в C ++.
Ghemical проект имеет графический пользовательский интерфейс (который основан на GNOME), и поддерживает оба квантовой механики (полу-эмпирические и неэмпирические) и модели молекулярной механики (имеется экспериментальная Трипос 5.2, как силовое поле для органического molecu Также инструмент для снижения моделей белковых [1] входит в стоимость. Оптимизация геометрии, молекулярная динамика и большой набор инструментов визуализации доступны в данный момент.
Ghemical полагается на внешний код, чтобы обеспечить квантовые вычисления. Полу-эмпирические методы MNDO, MINDO / 3, AM1 и PM3 приходят из MOPAC7 пакета (Public Domain), и включены в исходный дистрибутив.
Пакет MPQC (GNU GPL) используется для обеспечения первопринципных методов: методы, основанные на теории Хартри-Фока в настоящее время поддерживается базисных наборов, начиная от STO-3G 6-31G ** с.
Код MPQC не включены в дистрибутив исходного кода. Для того, чтобы использовать MPQC основе в первопринципных методов в Ghemical, вы должны сначала собрать и установить программу MPQC для вашей системы, а затем скомпилировать Ghemical использовать некоторые специфические параметры, которые связывают программы вместе; посмотреть файл установки для получения дополнительной информации. Ghemical также содержит пакет OpenBabel для импорта и экспорта различных форматов файлов (а также другие задачи).
Монтаж
После того как вы скачали последнюю версию, вы должны извлечь все файлы из архива файла с помощью "деготь -zxvvf ghemical-1.00.tgz" или, что эквивалентно "Gunzip ghemical-1.00.tgz; тар -xvvf ghemical-1.00.tar". После этого, пожалуйста, прочтите "УСТАНОВИТЬ" -файл вы просто извлекается, чтобы получить дополнительную информацию.
Что нового в этой версии:
Комментарии не найдены